基因组成像与编辑
Multicolor CRISPR (Ma et al., PNAS 2015), CRISPR-Broccoli (Ma et al., J Cell Biol 2016), CRISPRainbow (Ma et al., Nat Biotechnol 2016), CRISPR-Sirius (Ma et al., Nat Methods 2018) 等基于 CRISPR 系统的基因组成像技术需要有高拷贝的靶标序列。然而这些靶标序列并不容易寻找。为了解决这一问题，我们开发了 CRISPRbar 工具
UCSC Genome Browser 是 加利福尼亚大学圣克鲁兹分校 (UCSC)托管的在线基因组浏览器。它提供了多种脊椎动物、无脊椎动物的基因组序列，并集成了大量的基因注释。
FISH 探针设计
使用生物信息技术设计的FISH探针数据集。 如果需要从 Oligopaints 数据集中寻找需要的探针，我们有这个小工具。
OligoMinerApp: 一个基于OligoMiner开发的在线FISH探针设计网页应用。
小工具
NCBI gene downloader: 在设计FISH探针或者基因编辑的时候，我们需要将基因在基因组中的序列下载下来，而且通常需要将其上下游的部分基因同时下载。通常的流程是在NCBI中找到基因的位置后，计算上下游的要同时下载的序列位置，再更新输入的信息。虽然计算不复杂，但是当你的实验涉及多个基因时，这将花费很多时间。这个小工具就是为解决这一问题而生。输入基因位置以及你想包含的上下游基因长度，就能得到该基因的GeneBank文件。详情请阅此处
Protocols
